船舶出资人与登记人的主要区别在于法律地位和权利义务。船舶出资人通常是船舶的实际拥有者，为船舶的购买或建造提供资金，而登记人则是依法在船舶登记机构进行登记，成为船舶法律上的所有者。根据《中华人民共和国船舶登记条例》，登记人享有船舶的所有权、处分权等权益，承担相应的法律责任。若出资人与登记人不一致，未及时处理可能会导致权益纠纷和法律风险。
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